Protein–RNA interactions for Protein: Q13439

GOLGA4, Golgin subfamily A member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA4Q13439 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA4Q13439 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GOLGA4Q13439 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GOLGA4Q13439 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GOLGA4Q13439 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms