Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms