Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
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SKP2Q13309 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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SKP2Q13309 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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SKP2Q13309 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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SKP2Q13309 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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SKP2Q13309 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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SKP2Q13309 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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