Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME3Q13232 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME3Q13232 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME3Q13232 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME3Q13232 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME3Q13232 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME3Q13232 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME3Q13232 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME3Q13232 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME3Q13232 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME3Q13232 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME3Q13232 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NME3Q13232 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME3Q13232 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME3Q13232 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME3Q13232 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME3Q13232 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NME3Q13232 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME3Q13232 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME3Q13232 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME3Q13232 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME3Q13232 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME3Q13232 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME3Q13232 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NME3Q13232 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NME3Q13232 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NME3Q13232 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME3Q13232 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME3Q13232 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME3Q13232 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME3Q13232 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME3Q13232 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME3Q13232 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME3Q13232 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME3Q13232 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME3Q13232 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NME3Q13232 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME3Q13232 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME3Q13232 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME3Q13232 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME3Q13232 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NME3Q13232 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME3Q13232 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME3Q13232 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME3Q13232 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME3Q13232 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME3Q13232 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME3Q13232 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME3Q13232 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME3Q13232 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NME3Q13232 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME3Q13232 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME3Q13232 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME3Q13232 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME3Q13232 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME3Q13232 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME3Q13232 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME3Q13232 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME3Q13232 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME3Q13232 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME3Q13232 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME3Q13232 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME3Q13232 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME3Q13232 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME3Q13232 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME3Q13232 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME3Q13232 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME3Q13232 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME3Q13232 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME3Q13232 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME3Q13232 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NME3Q13232 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NME3Q13232 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NME3Q13232 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NME3Q13232 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NME3Q13232 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NME3Q13232 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NME3Q13232 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NME3Q13232 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NME3Q13232 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NME3Q13232 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NME3Q13232 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NME3Q13232 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NME3Q13232 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NME3Q13232 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NME3Q13232 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NME3Q13232 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NME3Q13232 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NME3Q13232 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NME3Q13232 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NME3Q13232 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NME3Q13232 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NME3Q13232 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NME3Q13232 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NME3Q13232 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NME3Q13232 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME3Q13232 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME3Q13232 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME3Q13232 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME3Q13232 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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