Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CBX3Q13185 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CBX3Q13185 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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