Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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