Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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