Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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