Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TROQ12816 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TROQ12816 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TROQ12816 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TROQ12816 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TROQ12816 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TROQ12816 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TROQ12816 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TROQ12816 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TROQ12816 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TROQ12816 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TROQ12816 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TROQ12816 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TROQ12816 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TROQ12816 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TROQ12816 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TROQ12816 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TROQ12816 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TROQ12816 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TROQ12816 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TROQ12816 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TROQ12816 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TROQ12816 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TROQ12816 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TROQ12816 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TROQ12816 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TROQ12816 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TROQ12816 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TROQ12816 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TROQ12816 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TROQ12816 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TROQ12816 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TROQ12816 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TROQ12816 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TROQ12816 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TROQ12816 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TROQ12816 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TROQ12816 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TROQ12816 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TROQ12816 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TROQ12816 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TROQ12816 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TROQ12816 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TROQ12816 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TROQ12816 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TROQ12816 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TROQ12816 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TROQ12816 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TROQ12816 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TROQ12816 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TROQ12816 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TROQ12816 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TROQ12816 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TROQ12816 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TROQ12816 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TROQ12816 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TROQ12816 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TROQ12816 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TROQ12816 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TROQ12816 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TROQ12816 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TROQ12816 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TROQ12816 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TROQ12816 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TROQ12816 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TROQ12816 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TROQ12816 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TROQ12816 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TROQ12816 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TROQ12816 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TROQ12816 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TROQ12816 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TROQ12816 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TROQ12816 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TROQ12816 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TROQ12816 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TROQ12816 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TROQ12816 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TROQ12816 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TROQ12816 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TROQ12816 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TROQ12816 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TROQ12816 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TROQ12816 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TROQ12816 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TROQ12816 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TROQ12816 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TROQ12816 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TROQ12816 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TROQ12816 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TROQ12816 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TROQ12816 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TROQ12816 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TROQ12816 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TROQ12816 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TROQ12816 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TROQ12816 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TROQ12816 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TROQ12816 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TROQ12816 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
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