Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms