Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms