Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms