Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms