Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms