Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms