Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms