Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms