Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms