Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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H3F3AP84243 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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H3F3AP84243 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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H3F3AP84243 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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