Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms