Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VBP1P61758 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
VBP1P61758 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VBP1P61758 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VBP1P61758 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
VBP1P61758 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
VBP1P61758 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VBP1P61758 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
VBP1P61758 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
VBP1P61758 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VBP1P61758 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VBP1P61758 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
VBP1P61758 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VBP1P61758 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VBP1P61758 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VBP1P61758 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VBP1P61758 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VBP1P61758 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VBP1P61758 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VBP1P61758 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VBP1P61758 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VBP1P61758 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VBP1P61758 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VBP1P61758 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VBP1P61758 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VBP1P61758 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VBP1P61758 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VBP1P61758 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VBP1P61758 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VBP1P61758 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VBP1P61758 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VBP1P61758 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VBP1P61758 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VBP1P61758 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VBP1P61758 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VBP1P61758 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VBP1P61758 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VBP1P61758 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VBP1P61758 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VBP1P61758 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VBP1P61758 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VBP1P61758 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VBP1P61758 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VBP1P61758 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VBP1P61758 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
VBP1P61758 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VBP1P61758 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VBP1P61758 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VBP1P61758 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VBP1P61758 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VBP1P61758 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VBP1P61758 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VBP1P61758 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VBP1P61758 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
VBP1P61758 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VBP1P61758 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VBP1P61758 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VBP1P61758 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VBP1P61758 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VBP1P61758 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VBP1P61758 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VBP1P61758 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VBP1P61758 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VBP1P61758 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VBP1P61758 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VBP1P61758 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VBP1P61758 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
VBP1P61758 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15□□□□□ -0.01
VBP1P61758 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VBP1P61758 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VBP1P61758 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VBP1P61758 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VBP1P61758 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VBP1P61758 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VBP1P61758 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VBP1P61758 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VBP1P61758 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VBP1P61758 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VBP1P61758 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VBP1P61758 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VBP1P61758 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VBP1P61758 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VBP1P61758 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15□□□□□ -0.01
VBP1P61758 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15□□□□□ -0.01
VBP1P61758 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15□□□□□ -0.01
VBP1P61758 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VBP1P61758 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VBP1P61758 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VBP1P61758 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VBP1P61758 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VBP1P61758 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VBP1P61758 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VBP1P61758 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VBP1P61758 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VBP1P61758 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VBP1P61758 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VBP1P61758 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
VBP1P61758 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VBP1P61758 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VBP1P61758 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms