Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms