Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB25P57735 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB25P57735 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB25P57735 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB25P57735 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB25P57735 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB25P57735 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB25P57735 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB25P57735 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB25P57735 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB25P57735 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB25P57735 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB25P57735 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB25P57735 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB25P57735 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB25P57735 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB25P57735 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB25P57735 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB25P57735 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB25P57735 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB25P57735 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB25P57735 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB25P57735 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB25P57735 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB25P57735 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB25P57735 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB25P57735 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB25P57735 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB25P57735 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB25P57735 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB25P57735 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB25P57735 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB25P57735 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB25P57735 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB25P57735 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB25P57735 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB25P57735 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB25P57735 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB25P57735 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB25P57735 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB25P57735 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB25P57735 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB25P57735 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB25P57735 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB25P57735 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB25P57735 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB25P57735 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB25P57735 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB25P57735 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB25P57735 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB25P57735 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB25P57735 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB25P57735 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB25P57735 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB25P57735 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB25P57735 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB25P57735 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB25P57735 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB25P57735 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB25P57735 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB25P57735 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB25P57735 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB25P57735 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB25P57735 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB25P57735 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB25P57735 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB25P57735 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB25P57735 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB25P57735 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB25P57735 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB25P57735 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB25P57735 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB25P57735 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB25P57735 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB25P57735 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB25P57735 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB25P57735 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB25P57735 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB25P57735 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB25P57735 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB25P57735 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB25P57735 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB25P57735 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB25P57735 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB25P57735 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB25P57735 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB25P57735 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB25P57735 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB25P57735 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB25P57735 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB25P57735 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB25P57735 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB25P57735 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB25P57735 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB25P57735 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB25P57735 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB25P57735 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB25P57735 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB25P57735 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB25P57735 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms