Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms