Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MRE11P49959 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MRE11P49959 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MRE11P49959 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MRE11P49959 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRE11P49959 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRE11P49959 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRE11P49959 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRE11P49959 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRE11P49959 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRE11P49959 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRE11P49959 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRE11P49959 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRE11P49959 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRE11P49959 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRE11P49959 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRE11P49959 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRE11P49959 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRE11P49959 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRE11P49959 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRE11P49959 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRE11P49959 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRE11P49959 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRE11P49959 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRE11P49959 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRE11P49959 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRE11P49959 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRE11P49959 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRE11P49959 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRE11P49959 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
MRE11P49959 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRE11P49959 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRE11P49959 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRE11P49959 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRE11P49959 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRE11P49959 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MRE11P49959 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MRE11P49959 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MRE11P49959 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MRE11P49959 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRE11P49959 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRE11P49959 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRE11P49959 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRE11P49959 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRE11P49959 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRE11P49959 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRE11P49959 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRE11P49959 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRE11P49959 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRE11P49959 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRE11P49959 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRE11P49959 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRE11P49959 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MRE11P49959 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRE11P49959 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRE11P49959 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRE11P49959 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRE11P49959 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRE11P49959 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRE11P49959 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRE11P49959 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRE11P49959 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRE11P49959 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRE11P49959 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRE11P49959 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRE11P49959 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRE11P49959 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRE11P49959 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRE11P49959 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRE11P49959 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRE11P49959 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRE11P49959 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRE11P49959 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRE11P49959 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MRE11P49959 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRE11P49959 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRE11P49959 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRE11P49959 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRE11P49959 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRE11P49959 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRE11P49959 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRE11P49959 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MRE11P49959 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRE11P49959 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRE11P49959 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRE11P49959 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MRE11P49959 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRE11P49959 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRE11P49959 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRE11P49959 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRE11P49959 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRE11P49959 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRE11P49959 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRE11P49959 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRE11P49959 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MRE11P49959 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MRE11P49959 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MRE11P49959 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MRE11P49959 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MRE11P49959 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms