Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms