Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NESP48681 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NESP48681 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NESP48681 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NESP48681 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NESP48681 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NESP48681 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NESP48681 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NESP48681 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NESP48681 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NESP48681 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NESP48681 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NESP48681 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NESP48681 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NESP48681 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NESP48681 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NESP48681 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NESP48681 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NESP48681 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NESP48681 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NESP48681 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NESP48681 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NESP48681 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NESP48681 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NESP48681 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NESP48681 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NESP48681 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NESP48681 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NESP48681 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NESP48681 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NESP48681 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NESP48681 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NESP48681 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NESP48681 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NESP48681 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
NESP48681 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NESP48681 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NESP48681 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NESP48681 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
NESP48681 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NESP48681 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NESP48681 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NESP48681 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NESP48681 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NESP48681 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NESP48681 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NESP48681 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NESP48681 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NESP48681 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NESP48681 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NESP48681 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NESP48681 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NESP48681 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NESP48681 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NESP48681 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NESP48681 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NESP48681 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NESP48681 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NESP48681 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NESP48681 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NESP48681 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NESP48681 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NESP48681 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NESP48681 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NESP48681 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NESP48681 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NESP48681 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NESP48681 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NESP48681 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NESP48681 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NESP48681 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NESP48681 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NESP48681 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NESP48681 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NESP48681 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NESP48681 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NESP48681 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NESP48681 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NESP48681 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NESP48681 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NESP48681 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NESP48681 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NESP48681 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NESP48681 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NESP48681 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NESP48681 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NESP48681 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NESP48681 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NESP48681 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NESP48681 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NESP48681 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NESP48681 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NESP48681 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NESP48681 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NESP48681 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NESP48681 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NESP48681 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NESP48681 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NESP48681 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NESP48681 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms