Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ME1P48163 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ME1P48163 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ME1P48163 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ME1P48163 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ME1P48163 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ME1P48163 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ME1P48163 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ME1P48163 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ME1P48163 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ME1P48163 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ME1P48163 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ME1P48163 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ME1P48163 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ME1P48163 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ME1P48163 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ME1P48163 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ME1P48163 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ME1P48163 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ME1P48163 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ME1P48163 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ME1P48163 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ME1P48163 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ME1P48163 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ME1P48163 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ME1P48163 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ME1P48163 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ME1P48163 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ME1P48163 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ME1P48163 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
ME1P48163 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ME1P48163 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
ME1P48163 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ME1P48163 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ME1P48163 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ME1P48163 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ME1P48163 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ME1P48163 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ME1P48163 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ME1P48163 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ME1P48163 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ME1P48163 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ME1P48163 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ME1P48163 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ME1P48163 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ME1P48163 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ME1P48163 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ME1P48163 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ME1P48163 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ME1P48163 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ME1P48163 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ME1P48163 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ME1P48163 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ME1P48163 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ME1P48163 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ME1P48163 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ME1P48163 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ME1P48163 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ME1P48163 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ME1P48163 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ME1P48163 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ME1P48163 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ME1P48163 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ME1P48163 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ME1P48163 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ME1P48163 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ME1P48163 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ME1P48163 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ME1P48163 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ME1P48163 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ME1P48163 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ME1P48163 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ME1P48163 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ME1P48163 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ME1P48163 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ME1P48163 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ME1P48163 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ME1P48163 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ME1P48163 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ME1P48163 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ME1P48163 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ME1P48163 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ME1P48163 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ME1P48163 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ME1P48163 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ME1P48163 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ME1P48163 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ME1P48163 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ME1P48163 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ME1P48163 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ME1P48163 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ME1P48163 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ME1P48163 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ME1P48163 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ME1P48163 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ME1P48163 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ME1P48163 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ME1P48163 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ME1P48163 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ME1P48163 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms