Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms