Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ETV4P43268 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ETV4P43268 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV4P43268 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV4P43268 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV4P43268 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV4P43268 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV4P43268 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV4P43268 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV4P43268 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV4P43268 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV4P43268 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV4P43268 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV4P43268 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV4P43268 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV4P43268 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV4P43268 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV4P43268 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV4P43268 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV4P43268 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV4P43268 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV4P43268 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV4P43268 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV4P43268 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV4P43268 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV4P43268 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV4P43268 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV4P43268 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV4P43268 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV4P43268 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV4P43268 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV4P43268 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV4P43268 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV4P43268 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV4P43268 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV4P43268 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV4P43268 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV4P43268 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV4P43268 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV4P43268 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV4P43268 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV4P43268 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV4P43268 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV4P43268 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV4P43268 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ETV4P43268 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ETV4P43268 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ETV4P43268 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ETV4P43268 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV4P43268 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV4P43268 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV4P43268 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV4P43268 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV4P43268 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV4P43268 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV4P43268 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV4P43268 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV4P43268 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV4P43268 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV4P43268 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV4P43268 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV4P43268 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV4P43268 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV4P43268 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV4P43268 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV4P43268 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV4P43268 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV4P43268 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV4P43268 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV4P43268 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV4P43268 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV4P43268 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV4P43268 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV4P43268 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV4P43268 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV4P43268 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV4P43268 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV4P43268 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV4P43268 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV4P43268 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV4P43268 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV4P43268 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV4P43268 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV4P43268 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV4P43268 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV4P43268 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV4P43268 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV4P43268 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV4P43268 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV4P43268 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV4P43268 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV4P43268 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV4P43268 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV4P43268 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV4P43268 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV4P43268 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV4P43268 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV4P43268 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV4P43268 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV4P43268 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 405.5 ms