Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms