Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms