Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms