Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms