Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
BMI1P35226 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BMI1P35226 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BMI1P35226 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BMI1P35226 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BMI1P35226 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BMI1P35226 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BMI1P35226 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BMI1P35226 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BMI1P35226 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BMI1P35226 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BMI1P35226 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BMI1P35226 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BMI1P35226 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BMI1P35226 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BMI1P35226 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BMI1P35226 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BMI1P35226 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BMI1P35226 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
BMI1P35226 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
BMI1P35226 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.31
BMI1P35226 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
BMI1P35226 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BMI1P35226 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BMI1P35226 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BMI1P35226 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BMI1P35226 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BMI1P35226 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BMI1P35226 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BMI1P35226 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BMI1P35226 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BMI1P35226 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BMI1P35226 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BMI1P35226 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BMI1P35226 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BMI1P35226 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BMI1P35226 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BMI1P35226 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BMI1P35226 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BMI1P35226 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BMI1P35226 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BMI1P35226 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BMI1P35226 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BMI1P35226 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BMI1P35226 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms