Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms