Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL9P32969 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL9P32969 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL9P32969 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL9P32969 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL9P32969 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL9P32969 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL9P32969 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL9P32969 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL9P32969 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL9P32969 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL9P32969 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL9P32969 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL9P32969 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL9P32969 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL9P32969 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL9P32969 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL9P32969 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL9P32969 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL9P32969 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL9P32969 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL9P32969 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL9P32969 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL9P32969 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL9P32969 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL9P32969 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL9P32969 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL9P32969 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL9P32969 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL9P32969 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL9P32969 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL9P32969 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL9P32969 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL9P32969 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL9P32969 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL9P32969 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL9P32969 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL9P32969 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL9P32969 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL9P32969 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL9P32969 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL9P32969 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL9P32969 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL9P32969 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL9P32969 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL9P32969 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL9P32969 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL9P32969 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL9P32969 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL9P32969 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL9P32969 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL9P32969 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL9P32969 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL9P32969 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL9P32969 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL9P32969 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL9P32969 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL9P32969 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL9P32969 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL9P32969 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL9P32969 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL9P32969 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL9P32969 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL9P32969 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL9P32969 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL9P32969 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL9P32969 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL9P32969 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL9P32969 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL9P32969 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL9P32969 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL9P32969 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL9P32969 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL9P32969 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL9P32969 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL9P32969 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL9P32969 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL9P32969 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL9P32969 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL9P32969 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL9P32969 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL9P32969 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL9P32969 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL9P32969 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL9P32969 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL9P32969 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL9P32969 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL9P32969 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL9P32969 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL9P32969 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL9P32969 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL9P32969 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL9P32969 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL9P32969 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL9P32969 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL9P32969 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL9P32969 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL9P32969 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL9P32969 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL9P32969 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms