Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms