Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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