Protein–RNA interactions for Protein: P22736

NR4A1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A1P22736 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms