Protein–RNA interactions for Protein: P22612

PRKACG, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACGP22612 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms