Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms