Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHCEP18577 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHCEP18577 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHCEP18577 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHCEP18577 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHCEP18577 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHCEP18577 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHCEP18577 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHCEP18577 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHCEP18577 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHCEP18577 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHCEP18577 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHCEP18577 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHCEP18577 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHCEP18577 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHCEP18577 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHCEP18577 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHCEP18577 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHCEP18577 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHCEP18577 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHCEP18577 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHCEP18577 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHCEP18577 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHCEP18577 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHCEP18577 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHCEP18577 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHCEP18577 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHCEP18577 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHCEP18577 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHCEP18577 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHCEP18577 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHCEP18577 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHCEP18577 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHCEP18577 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHCEP18577 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHCEP18577 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHCEP18577 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHCEP18577 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHCEP18577 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHCEP18577 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHCEP18577 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHCEP18577 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHCEP18577 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHCEP18577 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHCEP18577 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHCEP18577 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHCEP18577 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHCEP18577 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHCEP18577 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHCEP18577 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHCEP18577 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHCEP18577 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHCEP18577 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHCEP18577 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHCEP18577 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHCEP18577 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHCEP18577 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHCEP18577 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHCEP18577 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHCEP18577 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHCEP18577 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHCEP18577 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHCEP18577 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHCEP18577 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHCEP18577 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHCEP18577 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHCEP18577 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHCEP18577 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHCEP18577 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHCEP18577 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHCEP18577 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHCEP18577 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHCEP18577 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHCEP18577 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHCEP18577 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHCEP18577 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHCEP18577 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHCEP18577 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RHCEP18577 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHCEP18577 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHCEP18577 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHCEP18577 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHCEP18577 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHCEP18577 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHCEP18577 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RHCEP18577 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RHCEP18577 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RHCEP18577 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHCEP18577 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHCEP18577 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RHCEP18577 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHCEP18577 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHCEP18577 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHCEP18577 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHCEP18577 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHCEP18577 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHCEP18577 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHCEP18577 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHCEP18577 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHCEP18577 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms