Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPI1P17947 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPI1P17947 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPI1P17947 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPI1P17947 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPI1P17947 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPI1P17947 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPI1P17947 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SPI1P17947 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPI1P17947 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPI1P17947 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPI1P17947 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPI1P17947 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPI1P17947 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPI1P17947 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPI1P17947 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPI1P17947 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPI1P17947 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPI1P17947 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPI1P17947 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPI1P17947 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPI1P17947 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPI1P17947 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SPI1P17947 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SPI1P17947 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPI1P17947 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPI1P17947 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPI1P17947 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPI1P17947 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPI1P17947 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPI1P17947 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPI1P17947 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPI1P17947 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPI1P17947 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPI1P17947 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPI1P17947 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPI1P17947 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SPI1P17947 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPI1P17947 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SPI1P17947 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPI1P17947 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPI1P17947 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SPI1P17947 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SPI1P17947 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SPI1P17947 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SPI1P17947 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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SPI1P17947 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SPI1P17947 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPI1P17947 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SPI1P17947 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPI1P17947 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPI1P17947 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPI1P17947 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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