Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMP4P12644 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMP4P12644 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMP4P12644 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BMP4P12644 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMP4P12644 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMP4P12644 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMP4P12644 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMP4P12644 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMP4P12644 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMP4P12644 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMP4P12644 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMP4P12644 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMP4P12644 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMP4P12644 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMP4P12644 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMP4P12644 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMP4P12644 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMP4P12644 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMP4P12644 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMP4P12644 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMP4P12644 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMP4P12644 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMP4P12644 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMP4P12644 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BMP4P12644 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BMP4P12644 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BMP4P12644 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BMP4P12644 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BMP4P12644 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BMP4P12644 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BMP4P12644 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BMP4P12644 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BMP4P12644 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BMP4P12644 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BMP4P12644 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BMP4P12644 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BMP4P12644 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BMP4P12644 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BMP4P12644 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BMP4P12644 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BMP4P12644 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BMP4P12644 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BMP4P12644 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BMP4P12644 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BMP4P12644 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BMP4P12644 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BMP4P12644 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BMP4P12644 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BMP4P12644 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BMP4P12644 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BMP4P12644 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BMP4P12644 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BMP4P12644 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BMP4P12644 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BMP4P12644 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BMP4P12644 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BMP4P12644 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BMP4P12644 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BMP4P12644 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BMP4P12644 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BMP4P12644 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BMP4P12644 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BMP4P12644 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BMP4P12644 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BMP4P12644 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BMP4P12644 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BMP4P12644 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BMP4P12644 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BMP4P12644 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BMP4P12644 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BMP4P12644 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BMP4P12644 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BMP4P12644 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BMP4P12644 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BMP4P12644 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BMP4P12644 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BMP4P12644 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BMP4P12644 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BMP4P12644 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BMP4P12644 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BMP4P12644 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BMP4P12644 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BMP4P12644 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BMP4P12644 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BMP4P12644 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BMP4P12644 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BMP4P12644 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BMP4P12644 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BMP4P12644 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BMP4P12644 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BMP4P12644 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BMP4P12644 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BMP4P12644 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BMP4P12644 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BMP4P12644 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BMP4P12644 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BMP4P12644 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BMP4P12644 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BMP4P12644 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms