Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODC1P11926 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ODC1P11926 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODC1P11926 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ODC1P11926 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODC1P11926 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ODC1P11926 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ODC1P11926 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODC1P11926 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ODC1P11926 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODC1P11926 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODC1P11926 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ODC1P11926 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODC1P11926 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODC1P11926 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODC1P11926 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODC1P11926 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODC1P11926 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODC1P11926 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODC1P11926 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODC1P11926 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODC1P11926 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODC1P11926 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODC1P11926 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ODC1P11926 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODC1P11926 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODC1P11926 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODC1P11926 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODC1P11926 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODC1P11926 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODC1P11926 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODC1P11926 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODC1P11926 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODC1P11926 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODC1P11926 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODC1P11926 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODC1P11926 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODC1P11926 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODC1P11926 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODC1P11926 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ODC1P11926 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODC1P11926 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODC1P11926 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODC1P11926 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ODC1P11926 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODC1P11926 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODC1P11926 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODC1P11926 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODC1P11926 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODC1P11926 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODC1P11926 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODC1P11926 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODC1P11926 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODC1P11926 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODC1P11926 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODC1P11926 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODC1P11926 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODC1P11926 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODC1P11926 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODC1P11926 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODC1P11926 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ODC1P11926 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODC1P11926 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ODC1P11926 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODC1P11926 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODC1P11926 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODC1P11926 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODC1P11926 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODC1P11926 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODC1P11926 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODC1P11926 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODC1P11926 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODC1P11926 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODC1P11926 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODC1P11926 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODC1P11926 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODC1P11926 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODC1P11926 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODC1P11926 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODC1P11926 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODC1P11926 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODC1P11926 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODC1P11926 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODC1P11926 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODC1P11926 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODC1P11926 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODC1P11926 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODC1P11926 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODC1P11926 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODC1P11926 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ODC1P11926 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODC1P11926 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODC1P11926 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODC1P11926 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODC1P11926 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODC1P11926 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODC1P11926 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODC1P11926 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ODC1P11926 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODC1P11926 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms