Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

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Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DMDP11532 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DMDP11532 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DMDP11532 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DMDP11532 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DMDP11532 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DMDP11532 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DMDP11532 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DMDP11532 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DMDP11532 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DMDP11532 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DMDP11532 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DMDP11532 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DMDP11532 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DMDP11532 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DMDP11532 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DMDP11532 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DMDP11532 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DMDP11532 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DMDP11532 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DMDP11532 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DMDP11532 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DMDP11532 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DMDP11532 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DMDP11532 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DMDP11532 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DMDP11532 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DMDP11532 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DMDP11532 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DMDP11532 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DMDP11532 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DMDP11532 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DMDP11532 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DMDP11532 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DMDP11532 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DMDP11532 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DMDP11532 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DMDP11532 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DMDP11532 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DMDP11532 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DMDP11532 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DMDP11532 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DMDP11532 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DMDP11532 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DMDP11532 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DMDP11532 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DMDP11532 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DMDP11532 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DMDP11532 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DMDP11532 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DMDP11532 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DMDP11532 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DMDP11532 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DMDP11532 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DMDP11532 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DMDP11532 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DMDP11532 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DMDP11532 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DMDP11532 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DMDP11532 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DMDP11532 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DMDP11532 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DMDP11532 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DMDP11532 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DMDP11532 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DMDP11532 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DMDP11532 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DMDP11532 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DMDP11532 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DMDP11532 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DMDP11532 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DMDP11532 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DMDP11532 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DMDP11532 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DMDP11532 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DMDP11532 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DMDP11532 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DMDP11532 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DMDP11532 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DMDP11532 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DMDP11532 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DMDP11532 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DMDP11532 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DMDP11532 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DMDP11532 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DMDP11532 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DMDP11532 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DMDP11532 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DMDP11532 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DMDP11532 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DMDP11532 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DMDP11532 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DMDP11532 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DMDP11532 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DMDP11532 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DMDP11532 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DMDP11532 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DMDP11532 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DMDP11532 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DMDP11532 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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