Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3P10147 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3P10147 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3P10147 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3P10147 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3P10147 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3P10147 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3P10147 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3P10147 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3P10147 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3P10147 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3P10147 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3P10147 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3P10147 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3P10147 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3P10147 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3P10147 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3P10147 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3P10147 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3P10147 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3P10147 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3P10147 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3P10147 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3P10147 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3P10147 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3P10147 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3P10147 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3P10147 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3P10147 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3P10147 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3P10147 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3P10147 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3P10147 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3P10147 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3P10147 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3P10147 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3P10147 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3P10147 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3P10147 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3P10147 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3P10147 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3P10147 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3P10147 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3P10147 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3P10147 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3P10147 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3P10147 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3P10147 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3P10147 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3P10147 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3P10147 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3P10147 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3P10147 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3P10147 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3P10147 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3P10147 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3P10147 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3P10147 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms