Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
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