Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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